Deine Route gefällt mir gut und die Wege sind gut machbar. Waterton/Glacier würde ich drin lassen, der Park hat mir vor etlichen Jahren gut gefallen und bot schöne Wandermöglichkeiten.
NY würde ich aber ans Ende der Reise legen. Du bist dann ausgeruht und hast viel Natur gesehen, also bereit für den Big Apple. Hatte ich selbst in diesem Sommer auch so gemacht und nach reichlich Natur die 5 Nächte in NY genossen.
Im Lassen und auch im Crater Lake solltest du noch mit Schnee rechnen, sodass viele Wanderwege noch nicht freigegeben sind.